Dem Ausbruch der Erkrankung geht eine Infektion mit dem Tauben-Circovirus voran, welches unter Stresssituationen wie z.B. sommerlichen Temperaturen, Überbesetzung der Schläge, langen Transporten oder der Jungtaubenreise reaktiviert wird. Vermutlich übertragen infizierte Alttauben das Circovirus über Kot, Federstaub und Kropfmilch auf die Jungtiere. Eine ursächliche Beteiligung von Adenoviren und/oder Herpesviren an der Jungtaubenkrankheit ist nicht auszuschließen.